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       实验室上级主管部门为自然资源部东海局,主管处室为海洋自然资源调查与科技处,业务指导处室4个,分别为海洋生态修复处、海洋预警监测处、海域海岛管理处和海洋自然资源管理处。
       实验室由4家单位共建组成,依托单位为“东海生态中心”,共建单位为“东海预报减灾中心”、“东海调查中心”和“上海海洋大学”,局属其他业务中心和中心站作为参与单位,参加团队构建。